再給芹菜施用肥料的時候主要分為有苗床施肥和本田施肥。由于芹菜苗齡較長，為培育壯苗，苗床施肥應在有機肥基礎上，每畝施尿素15公斤，過磷酸鈣50公斤，硫酸鉀或氯化鉀10公斤，出苗后根據苗的長勢在中后期追施適量氮肥。本田施肥分基肥和追肥。

1、基肥。定植前要施足基肥，在施用優質有機肥3000公斤基礎上，每畝施高濃度復合肥35～40公斤，或尿素10～15公斤，普鈣50公斤、硫酸鉀(名氯化鉀)10～15公斤。

2、追肥。一般為2次。芹菜定植緩苗后的生長初期，發育緩慢，養分吸收量少，可以不施肥。到植株長出5～6片葉時進入生長盛期，進行次追肥，每畝施尿素10～15公斤。相隔15～20天后約植株長出8～9片葉時，進行第二次追肥。這次肥應重施，并要求氮、磷、鉀化肥配合施用，每畝可施用氮、磷、鉀養分配比為1:0.5:1的高濃度復合肥20～30公斤。在旺盛生長期，還可以進行葉面追肥，如噴施0.5%尿素溶液，或0.2%的硝酸鉀溶液。秋季干旱容易缺硼，可以用0.2%～0.5%的硼砂溶液噴施，防止葉柄粗糙和龜裂。