殺菌劑是用于防治由各種病原微生物引起的植物病害的一類農藥，合理配置濃度不同的殺菌劑其使用濃度都有特殊要求，配置濃度時一定要嚴格按照“使用說明書”操作，不可隨意加大或縮小。

選準噴施時間噴施殺菌劑時間過遲或過早都會影響防治效果。應根據作物不同病害的發生規律和具體情況及時用藥。通常在發病前（保護用藥）或發病初期（防患于未然）使用為佳。

掌握用藥次數殺菌劑的噴藥次數主要是根據藥劑持效期的長短和氣象條件來確定。一般每隔10～15天噴一次，共噴2～3次。遇特殊情況，如施藥后遇雨，應及時補噴一次。

提高用藥質量用藥數量要適宜，用藥過多會增大成本、易造成藥害，而用藥過少則無法達到用藥目的。用藥質量要講究，噴藥時要求噴霧均勻，力求做到不漏噴。

嚴格防止藥害殺菌劑造成藥害有多種原因，首先一般水溶性較強的藥劑容易發生藥害，其次不同作物對藥劑的敏感性也不同，例如波爾多液一般不會造成藥害，但對銅敏感的作物也會產生藥害。豆類、馬鈴薯、棉花則對石硫合劑敏感。再者作物的不同生長發育階段對藥劑的反應也不同，一般幼苗和孕穗開花階段容易產生藥害。另外，一般高溫干旱、日照強烈或霧重、高濕等條件下用藥易引起作物藥害。

謹慎混用殺菌劑不少為堿性農藥，故不能與遇堿性物質易分解失效的殺蟲劑混用，如波爾多液、石硫合劑等呈堿性。還有一些殺菌劑如多菌靈不能與波爾多液、石硫合劑、托布津等殺菌劑混用，同樣會造成殺蟲（菌）微生物喪失生理活性和殺蟲（菌）能力而失效。

注意規避抗藥性使用殺菌劑也存在作物病害的抗藥性問題。為規避病害抗藥性，要在科學選用農藥的基礎上，切實做好不同類型的藥劑的交替（輪換）使用，嚴禁長期單獨使用一種農藥。

稻瘟病可選稻瘟凈、稻瘟靈、三環唑等，小麥白粉病、銹病要選三唑醇、三唑酮等，花生葉斑病要選甲基硫菌靈等，不同作物要使用不同的藥劑，農民朋友千萬不要弄錯了。