福建省農(nóng)業(yè)科學院成立于1960年，是福建省的農(nóng)牧業(yè)綜合科研機構。現(xiàn)設有水稻、果樹、畜牧獸醫(yī)、植物保護、土壤肥料、甘蔗、茶葉、作物、農(nóng)業(yè)工程技術、農(nóng)業(yè)經(jīng)濟與科技信息、農(nóng)業(yè)生態(tài)、生物技術、農(nóng)業(yè)生物資源等研究所和中心實驗室、蘑菇菌種研究推廣站等15個研究單位和1個科技干部培訓中心。目前已建有福州國家水稻改良分中心、國家龍眼枇杷資源圃、國家紅萍品種資源圃，2個省級重點實驗室、8個省級工程技術研究中心，有130多公頃實驗場、圃，保存珍貴作物種質(zhì)資源13000多份。
在職職工1080人，其中：高級專業(yè)技術人員313人，中級專業(yè)技術人員283人；有中國科學院院士1人、專家5人、省級專家14人、享受特殊津貼76人；有博士（含在讀）81人、碩士179（含在讀）人；有35位科技人員進入國家、省“百千萬人才工程”人選。人事部在我院設立了博士后工作站和引智基地；2005年中國農(nóng)業(yè)科學院研究生院與福建省農(nóng)業(yè)科學院聯(lián)合創(chuàng)辦研究生教學實習基地。1978年—2006年，共取得國家、部省級科技獎勵成果319項，其中省部級二等獎以上重大成果74項。
福建省農(nóng)業(yè)科學院堅持以應用研究和開發(fā)研究為主，適當開展基礎研究，著力提高科技創(chuàng)新能力，在作物育種、動物疫病防治、畜禽飼料、生物農(nóng)藥、植物保護、食（藥）用菌、農(nóng)業(yè)生態(tài)、臺灣農(nóng)業(yè)等研究具有較強科技力量。在超級稻育種、水稻轉基育種、枇杷龍眼雜交育種、畜禽疫苗、生物農(nóng)藥、害蟲天敵捕食螨生防技術、歐鰻小瓜蟲血清型研究、鴨出血癥病原學研究、柑桔黃龍病研究、紅萍研究等方面研究居世界先進水平。